Pracownia Farmakogenomiki
Profil naukowy
- O pracowni
- Pracownicy
- Zakład nadrzędny
Przedmiotem badań naukowych prowadzonych w Pracowni jest poszukiwanie biologicznych korelatów stanów i procesów powiązanych z farmakoterapią występujących na poziomie molekularnym. Celem jest identyfikacja nowych punktów uchwytu, wskaźników efektywności i bezpieczeństwa terapii oraz interakcji leki-geny o znaczeniu klinicznym. W szczególności badania dotyczą leków psychotropowych stosowanych w leczeniu depresji, zaburzeń psychotycznych i lękowych oraz innych związków psychoaktywnych.
Badania prowadzone są na poziomie genów, zarówno w zakresie różnic w sekwencji DNA występujących u ludzi jak i zmian poziomów ekspresji poszczególnych transkryptów. Wspólnym elementem metodycznym jest stosowane bioinformatycznych narzędzi do analizy i interpretacji dużych zbiorów danych genomowych. Podstawowym źródłem wyników jest technologia wysokoprzepustowego sekwencjonowania DNA (NGS, ang. next-generation sequencing), która umożliwia pomiary w skali pełnej sekwencji genomów oraz transkryptomów. Wysokoprzepustowe sekwencjonowanie pozwala zarówno na prowadzenie asocjacyjnych badań genetycznych, jak pomiarów zmian ekspresji izoform transkrypcyjnych oraz niekodujących RNA.
dr hab. Michał Korostyński
Kierownik pracowni
Pracownicy pracowni
dr Marcin Piechota
dr Małgorzata Borczyk
Doktoranci
Dokonania naukowe
- Publikacje
Comparison of gene expression profiles in neuropathic and inflammatory pain
Parkitna, J.R., Korostynski, M., Kaminska-Chowaniec, D., Obara, I., Mika, J., Przewlocka, B., Przewlocki, R.
DOI:
Quantitative morphological study of microglial cells in the ischemic rat brain using principal component analysis
Soltys, Z., Orzylowska-Sliwinska, O., Zaremba, M., Orlowski, D., Piechota, M., Fiedorowicz, A., Janeczko, K., Oderfeld-Nowak, B.
DOI: 10.1016/j.jneumeth.2005.01.009