Pracownia Farmakogenomiki
Profil naukowy
- O pracowni
- Pracownicy
- Zakład nadrzędny
Przedmiotem badań naukowych prowadzonych w Pracowni jest poszukiwanie biologicznych korelatów stanów i procesów powiązanych z farmakoterapią występujących na poziomie molekularnym. Celem jest identyfikacja nowych punktów uchwytu, wskaźników efektywności i bezpieczeństwa terapii oraz interakcji leki-geny o znaczeniu klinicznym. W szczególności badania dotyczą leków psychotropowych stosowanych w leczeniu depresji, zaburzeń psychotycznych i lękowych oraz innych związków psychoaktywnych.
Badania prowadzone są na poziomie genów, zarówno w zakresie różnic w sekwencji DNA występujących u ludzi jak i zmian poziomów ekspresji poszczególnych transkryptów. Wspólnym elementem metodycznym jest stosowane bioinformatycznych narzędzi do analizy i interpretacji dużych zbiorów danych genomowych. Podstawowym źródłem wyników jest technologia wysokoprzepustowego sekwencjonowania DNA (NGS, ang. next-generation sequencing), która umożliwia pomiary w skali pełnej sekwencji genomów oraz transkryptomów. Wysokoprzepustowe sekwencjonowanie pozwala zarówno na prowadzenie asocjacyjnych badań genetycznych, jak pomiarów zmian ekspresji izoform transkrypcyjnych oraz niekodujących RNA.
Pracownicy pracowni
dr Marcin Piechota
dr Małgorzata Borczyk
Doktoranci
Dokonania naukowe
- Publikacje
A model of alcohol drinking under an intermittent access schedule using group-housed mice
Smutek, M., Turbasa, M., Sikora, M., Piechota, M., Zajdel, J., Przewlocki, R., Parkitna, J.R.
DOI: 10.1371/journal.pone.0096787
CREB activity in dopamine D1 receptor expressing neurons regulates cocaine-induced behavioral effects
Bilbao, A., Rieker, C., Cannella, N., Parlato, R., Golda, S., Piechota, M., Korostynski, M., Engblom, D., Przewlocki, R., Schütz, G., Spanagel, R., Parkitna, J.R.
DOI: 10.3389/fnbeh.2014.00212
Novel drug-regulated transcriptional networks in brain reveal pharmacological properties of psychotropic drugs.
Korostynski M, Piechota M, Dzbek J, Mlynarski W, Szklarczyk K, Ziolkowska B, Przewlocki R
DOI: 10.1186/1471-2164-14-606
Controlling complexity: the clinical relevance of mouse complex genetics.
Schughart K, Libert C, SYSGENET consortium, Kas MJ
DOI: 10.1038/ejhg.2013.79
Gene expression profiling of blood in ruptured intracranial aneurysms: in search of biomarkers.
Pera J, Korostynski M, Golda S, Piechota M, Dzbek J, Krzyszkowski T, Dziedzic T, Moskala M, Przewlocki R, Szczudlik A, Slowik A
DOI: 10.1038/jcbfm.2013.37
Gene expression profiling of blood in ruptured intracranial aneurysms: In search of biomarkers
Pera, J., Korostynski, M., Golda, S., Piechota, M., Dzbek, J., Krzyszkowski, T., Dziedzic, T., Moskala, M., Przewlocki, R., Szczudlik, A., Slowik, A.
DOI: 10.1038/jcbfm.2013.37
Astrocytes are a neural target of morphine action via glucocorticoid receptor-dependent signaling
Slezak, M., Korostynski, M., Gieryk, A., Golda, S., Dzbek, J., Piechota, M., Wlazlo, E., Bilecki, W., Przewlocki, R.
DOI: 10.1002/glia.22460
Novel drug-regulated transcriptional networks in brain reveal pharmacological properties of psychotropic drugs
Korostynski, M., Piechota, M., Dzbek, J., Mlynarski, W., Szklarczyk, K., Ziolkowska, B., Przewlocki, R.
DOI: 10.1186/1471-2164-14-606
Astrocytes are a neural target of morphine action via glucocorticoid receptor-dependent signaling.
Slezak M, Korostynski M, Gieryk A, Golda S, Dzbek J, Piechota M, Wlazlo E, Bilecki W, Przewlocki R
DOI: 10.1002/glia.22460
Association between the A107V substitution in the δ-opioid receptors and ethanol drinking in mice selected for high and low analgesia.
Sacharczuk M, Lesniak A, Lipkowski AW, Korostynski M, Przewlocki R, Sadowski B
DOI: 10.1111/adb.12030